Perbedaan pendapat tersebut memicu perundingan antara pemerintah pusat dan perwakilan daerah yang tergabung dalam BFO. Perundingan ini bertujuan untuk mencari titik temu dan mencapai kompromi mengenai bentuk negara Indonesia.
Proses perundingan berlangsung alot dan penuh dinamika. Kedua belah pihak memiliki alasan dan kepentingan masing-masing. Pemerintah pusat menginginkan bentuk negara kesatuan untuk menjaga keutuhan Indonesia, sementara perwakilan daerah menginginkan bentuk negara federal untuk memberikan otonomi yang lebih luas kepada daerah.
Setelah melalui perundingan yang panjang dan melelahkan, akhirnya dicapai kompromi. Indonesia memilih bentuk negara kesatuan dengan tetap memberikan otonomi yang cukup luas kepada daerah. Kompromi ini menjadi solusi yang dapat diterima oleh semua pihak.
